MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 25390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	A	8	8	21	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001318	TAA	2	6	40	45	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001318	A	6	6	52	57	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001318	TATAA	2	10	65	74	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001318	TAT	3	9	75	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001318	AT	3	6	82	87	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001318	ACT	2	6	99	104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001318	TTA	2	6	132	137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15594347
9	NC_001318	ATTT	2	8	151	158	25 %	75 %	0 %	0 %	15594347
10	NC_001318	ACT	2	6	177	182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594347
11	NC_001318	AGA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15594347
12	NC_001318	A	10	10	216	225	100 %	0 %	0 %	0 %	15594347
13	NC_001318	AATG	2	8	321	328	50 %	25 %	25 %	0 %	15594347
14	NC_001318	T	7	7	356	362	0 %	100 %	0 %	0 %	15594347
15	NC_001318	CAA	2	6	370	375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15594347
16	NC_001318	T	6	6	468	473	0 %	100 %	0 %	0 %	15594347
17	NC_001318	ACT	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594347
18	NC_001318	AAC	2	6	524	529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15594347
19	NC_001318	TTC	2	6	550	555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15594347
20	NC_001318	TAA	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594347
21	NC_001318	CTT	2	6	625	630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15594347
22	NC_001318	TA	3	6	671	676	50 %	50 %	0 %	0 %	15594347
23	NC_001318	T	7	7	681	687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001318	T	7	7	698	704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001318	ATT	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001318	CTT	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15594348
27	NC_001318	TCA	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594348
28	NC_001318	ATA	2	6	979	984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594348
29	NC_001318	AGC	2	6	990	995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15594348
30	NC_001318	ATT	2	6	1020	1025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15594348
31	NC_001318	GTT	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15594348
32	NC_001318	ATT	2	6	1131	1136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15594348
33	NC_001318	TCC	2	6	1191	1196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15594348
34	NC_001318	TAA	2	6	1209	1214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594348
35	NC_001318	C	6	6	1336	1341	0 %	0 %	0 %	100 %	15594348
36	NC_001318	T	7	7	1376	1382	0 %	100 %	0 %	0 %	15594348
37	NC_001318	CTA	2	6	1396	1401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594348
38	NC_001318	C	6	6	1408	1413	0 %	0 %	0 %	100 %	15594348
39	NC_001318	TCA	2	6	1417	1422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594348
40	NC_001318	AATC	2	8	1467	1474	50 %	25 %	0 %	25 %	15594348
41	NC_001318	TAAA	2	8	1508	1515	75 %	25 %	0 %	0 %	15594348
42	NC_001318	T	6	6	1537	1542	0 %	100 %	0 %	0 %	15594348
43	NC_001318	ATC	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594348
44	NC_001318	AATA	2	8	1608	1615	75 %	25 %	0 %	0 %	15594348
45	NC_001318	A	7	7	1751	1757	100 %	0 %	0 %	0 %	15594348
46	NC_001318	A	6	6	1761	1766	100 %	0 %	0 %	0 %	15594348
47	NC_001318	A	6	6	1768	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	15594348
48	NC_001318	TA	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001318	ACA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_001318	AT	3	6	1900	1905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001318	TAA	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001318	AGGA	2	8	1949	1956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001318	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_001318	AT	3	6	2037	2042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001318	T	6	6	2083	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001318	TAT	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001318	TCA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_001318	T	6	6	2106	2111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001318	CAG	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_001318	GAA	2	6	2196	2201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001318	C	6	6	2204	2209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_001318	TCCC	2	8	2257	2264	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_001318	GCTTT	2	10	2274	2283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_001318	AGA	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001318	AATT	2	8	2344	2351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001318	AT	4	8	2379	2386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001318	TAAA	2	8	2414	2421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001318	GGCA	2	8	2456	2463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_001318	TAT	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001318	TCT	2	6	2574	2579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_001318	T	6	6	2579	2584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001318	AAAT	2	8	2624	2631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001318	AAAT	2	8	2647	2654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001318	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001318	TTG	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001318	CCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_001318	AAAG	2	8	2949	2956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001318	AAG	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001318	A	6	6	3001	3006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001318	CTT	2	6	3019	3024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_001318	T	7	7	3059	3065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001318	TTG	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001318	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001318	AAAACC	2	12	3255	3266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_001318	TTA	2	6	3280	3285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001318	A	7	7	3294	3300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001318	TAA	2	6	3315	3320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001318	ATT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001318	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001318	GAA	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001318	A	6	6	3431	3436	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
92	NC_001318	TGA	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365992270
93	NC_001318	GAT	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365992270
94	NC_001318	A	6	6	3493	3498	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
95	NC_001318	ATAAAG	2	12	3528	3539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365992270
96	NC_001318	TAA	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
97	NC_001318	ATT	2	6	3573	3578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365992270
98	NC_001318	ATTGG	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	365992270
99	NC_001318	ATT	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365992270
100	NC_001318	TAA	2	6	3666	3671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
101	NC_001318	CAAA	2	8	3672	3679	75 %	0 %	0 %	25 %	365992270
102	NC_001318	AGATT	2	10	3684	3693	40 %	40 %	20 %	0 %	365992270
103	NC_001318	T	6	6	3692	3697	0 %	100 %	0 %	0 %	365992270
104	NC_001318	A	6	6	3733	3738	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
105	NC_001318	TTTA	2	8	3758	3765	25 %	75 %	0 %	0 %	365992270
106	NC_001318	TGG	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365992270
107	NC_001318	ATA	2	6	3857	3862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
108	NC_001318	A	8	8	3872	3879	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
109	NC_001318	TAA	2	6	3897	3902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
110	NC_001318	TTAA	2	8	3908	3915	50 %	50 %	0 %	0 %	365992270
111	NC_001318	TGA	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365992270
112	NC_001318	TAA	2	6	3961	3966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
113	NC_001318	AAT	2	6	3967	3972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
114	NC_001318	AGAA	2	8	3979	3986	75 %	0 %	25 %	0 %	365992270
115	NC_001318	A	6	6	3985	3990	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
116	NC_001318	AAAGA	2	10	4078	4087	80 %	0 %	20 %	0 %	365992270
117	NC_001318	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
118	NC_001318	AAT	2	6	4108	4113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
119	NC_001318	GATA	2	8	4147	4154	50 %	25 %	25 %	0 %	365992270
120	NC_001318	TA	3	6	4191	4196	50 %	50 %	0 %	0 %	365992270
121	NC_001318	TAT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365992270
122	NC_001318	AATG	2	8	4250	4257	50 %	25 %	25 %	0 %	365992270
123	NC_001318	AT	3	6	4279	4284	50 %	50 %	0 %	0 %	365992270
124	NC_001318	ATC	2	6	4379	4384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365992270
125	NC_001318	A	6	6	4392	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
126	NC_001318	TAT	2	6	4436	4441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365992270
127	NC_001318	A	6	6	4450	4455	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
128	NC_001318	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365992270
129	NC_001318	A	6	6	4500	4505	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
130	NC_001318	T	6	6	4513	4518	0 %	100 %	0 %	0 %	365992270
131	NC_001318	TAGAG	2	10	4534	4543	40 %	20 %	40 %	0 %	365992270
132	NC_001318	GAT	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365992270
133	NC_001318	GATT	2	8	4593	4600	25 %	50 %	25 %	0 %	365992270
134	NC_001318	TAC	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365992270
135	NC_001318	ATT	2	6	4693	4698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365992270
136	NC_001318	ACA	2	6	4784	4789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365992270
137	NC_001318	GTAAT	2	10	4800	4809	40 %	40 %	20 %	0 %	365992270
138	NC_001318	ATC	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365992270
139	NC_001318	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
140	NC_001318	TAA	2	6	4909	4914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
141	NC_001318	AGT	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365992270
142	NC_001318	TTC	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365992270
143	NC_001318	GGA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365992270
144	NC_001318	TAA	2	6	5029	5034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
145	NC_001318	TTG	2	6	5040	5045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365992270
146	NC_001318	CTA	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365992270
147	NC_001318	A	6	6	5150	5155	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
148	NC_001318	TAA	2	6	5157	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
149	NC_001318	A	6	6	5161	5166	100 %	0 %	0 %	0 %	365992270
150	NC_001318	TAA	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992270
151	NC_001318	ATA	2	6	5204	5209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001318	AAT	2	6	5243	5248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_001318	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	365992271
156	NC_001318	ATTCC	2	10	5291	5300	20 %	40 %	0 %	40 %	365992271
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159	NC_001318	TCA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365992271
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161	NC_001318	CTT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365992271
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163	NC_001318	T	6	6	5476	5481	0 %	100 %	0 %	0 %	365992271
164	NC_001318	CTT	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365992271
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168	NC_001318	T	9	9	5649	5657	0 %	100 %	0 %	0 %	365992271
169	NC_001318	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992271
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172	NC_001318	ATTTT	2	10	5711	5720	20 %	80 %	0 %	0 %	365992271
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239	NC_001318	AT	3	6	8362	8367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_001318	TAA	2	6	9915	9920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594355
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